Séminaire du Lundi 22 janvier à 11h30 | dép. GENOME | Benjamin Linard invité par Céline Scornavacca |

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Ce lundi 22 janvier à 11h30 nous accueillerons Benjamin Linard invité par Céline Scornavacca équipe Phylogénie et Evolution Moleculaire

Il nous parlera de « Accelerating species identification in metagenomes via high-throughput phylogenetic placements » Phylogenetic placement allows to map sequence fragments on a reference phylogenetic tree and to identify the species relatives present in a given sample. When compared to alignment-based identification, phylogenetic placement shows the ability to precisely place the reads on particular ancestral branch, indicating that the sample holds a species that is not present in the reference database and diverged at the aforementioned branch. We developed a process which replaces the classical approach of query alignment + ML-based computations by an approach combining ancestral sequence reconstruction (ASR) and k-mer mapping. This process was implemented in the RAPPAS package. The approach was validated against existing phylogenetic placement methods and showed comparable accuracy while greatly increasing and simplifying the process of species identification.

Venez nombreux salle Louis Thaler à 11h30, bâtiment 22 au 2e étage à l’ISEM Bon séminaire !

Séminaire du Lundi 15 janvier à 11h30 | dép. DIVERSITE | Alison Duncan de l’équipe Métapopulation

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Bonne année 2018 à tou.te.s !

Ce lundi 15 janvier à 11h30 nous accueillerons Alison Duncande équipe Métapopulation

Elle nous parlera de :
Venez nombreux salle Louis Thaler à 11h30, bâtiment 22 au 2e étage à l’ISEM

Bon séminaire  ! !

Lien vers l’inscription pour le Séminaire du Lundi

Pensez à mettre votre nom quand l’invité n’est pas dans l’organigramme de l’Institut.

Les séminaires du Lundi, c’est quoi ?

Séminaire du Lundi 11 décembre à 11h30 | dép. DIVERSITE | Denis Bourguet & Thomas Guillemaud invités par Ophélie Ronce

Ce lundi 11 décembre à 11h30 nous accueillerons Denis Bourguet  et Thomas Guillemaud invités par Ophélie Ronce équipe Métapopulations

Ils nous parleront de PCI Evolutionary Biology,

Peer Community in : un système de recommandation public et gratuit de preprints

Le projet Peer Community in (PCI) a pour objectif d’offrir une alternative au système actuel de publication qui est notamment coûteux et peu transparent. PCI repose sur la publication d’évaluations critiques et de recommandations d’articles non encore publiés, mais déposés – et gratuitement accessibles – sous forme électronique dans des archives ouvertes disponibles sur internet. Ces évaluations et recommandations sont réalisées bénévolement par les chercheurs sans aucun lien avec des éditeurs privés. 
Les frais de publication disparaissent : PCI valide (ou non) des articles diffusés, consultables gratuitement et qui lui sont soumis. Les délais d’accès à l’information sont nuls : les articles scientifiques évalués sont déposés dans les archives ouvertes dès la fin de leur écriture. Le système devient transparent : les critiques, les décisions éditoriales, les réponses des auteurs et les recommandations sont publiées sur le site de la communauté scientifique concernée.
Nous présenterons particulièrement la 1ere PCI, PCI Evolutionary Biology, dans laquelle la communauté montpelliéraine est bien représentée.

Venez nombreux salle Louis Thaler à 11h30, bâtiment 22 au 2e étage à l’ISEM

Bon séminaire !

Séminaire du Lundi 4 décembre à 11h30 | dép. DIVERSITE | Fernando Seixas équipe Sexe & spéciation | « The genomics of historical hybridization in hares from the Iberian Peninsula »

Ce lundi 4 décembre à 11h30 nous accueillerons Fernando Seixas de équipe Sexe & spéciation, Fernando Seixas est thésard en co-tutelle entre UM et U Porto (Portugal), co-dirigé par José Melo-Ferreira et Pierre Boursot.

Il a soutenu sa thèse le 28 novembre à l’Université de Porto et la présentera donc à Montpellier à l’occasion de ce séminaire.

Il nous parlera de : « The genomics of historical hybridization in hares from the Iberian Peninsula »
Venez nombreux salle Louis Thaler à 11h30, bâtiment 22 au 2e étage à l’ISEM

Bon séminaire !

les médailles de bronze 2017 Elise & Sonia

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Elise Huchard et Sonia Kéfi ont reçu vendredi 24 novembre la médaille de bronze 2017 du CNRS. Un Grand BRAVO à vous 2 !

La médaille de bronze récompense le premier travail d’un chercheur, qui fait de lui un spécialiste de talent dans son domaine. Cette récompense représente un encouragement du CNRS à poursuivre des recherches bien engagées et déjà fécondes.

 

Séminaire du Lundi 27 novembre à 11h30 | dép. GENOME | Jean-Philippe Lessard invité de Pierre-Henri Fabre

Ce lundi 27 novembre à 11h30 nous accueillerons Jean-Philippe Lessard invité de Pierre-Henri Fabre équipe Phylogénie et Evolution Moleculaire

Il nous parlera de « New outlook on the distribution and maintenance of biological diversity: global to local patterns of phylogenetic assemblage structure”.

Venez nombreux salle Louis Thaler à 11h30, bâtiment 22 au 2e étage à l’ISEM

Bon séminaire !

APPEL A VOTER | Faites gagner votre collègue et al. | Grand jeu concours pour faire séquencer le génome du Catshark

Mélanie et ses collègues ont besoin de votre vote ! Participez à ce concours d’un nouveau genre pour faire gagner la « petite roussette/Catshark« .

 

Votez avec vos comptes : Facebook, Google, Twitter ou Windows live et faites les gagner !


Message de Mélanie Debiais-Thibaud équipe Macroévolution et Développement

Nous avons, avec quelques collègues, réussi à faire participer la petite roussette à un grand jeu concours pour faire séquencer son génome par l’institut Sanger.

Pour gagner, que faut-il ?? Voter avec vos comptes : Facebook, Google, Twitter ou Windows live.
Si avec un click, vous réussissez à faire gagner la petite roussette, je vous devrai une fière chandelle !

Pour ceux-celles qui sont motivEés, voici le lien : https://iconic25.imascientist.org.uk/profile/lesserspottedcatshark/

Faites passer le message !!

Mélanie Debiais-Thibaud