Thu hien to

thu-hien.to@univ-montp2.fr
Post-Doctorant(e)

Je suis post-doctorant à l’ISEM, dans l’équipe Phylogénie et Evolution Moléculaire. Je suis intéressée par des algorithmes et de la modélisation dans phylogénie. Je travaille sur plusieurs thèmes, e.g. réseaux phylogénétiques, algorithmes de graphes dans phylogénie, datation moléculaire, réconciliation d’arbres des gènes …

Papers

  1. Michel Habib, Thu-Hien To: Level-k Phylogenetic Networks Are Constructable from a Dense Triplet Set in Polynomial Time. CPM 2009: 275-288

  2. Michel Habib, Thu-Hien To: On a Conjecture about Compatibility of Multi-states Characters. WABI 2011: 116-127

  3. Michel Habib, Thu-Hien To: Constructing a Minimum phylogenetic Network from a Dense triplet Set. J. Bioinformatics and Computational Biology 10(5) (2012)

  4. Thu-Hien To, Matthieu Jung, Samantha Lycette, and Olivier Gascuel, Fast Dating Using Least-squares Criteria and Algorithms, Systematic Biology 2015; doi: 10.1093/sysbio/syv068

  5. Thu-Hien To, Celine Scornavacca, Efficient algorithms for reconciling gene trees and species networks via duplication and loss events, BMC Genomics 2015, 16(Suppl 10):S6

  6. Thu-Hien To, Edwin Jacox, Vincent Ranwez, and Celine Scornavacca, Fast methods for Calculating Event Supports in Gene Tree Reconcliations, BMC Bioinformatics 2015 Nov 14;16(1):384

Software

LSD, a fast software to estimate substitution rate and divergence times http://www.atgc-montpellier.fr/LSD/