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Media Fitri Isma (Pipit) NUGRAHA

Doctorant(e) Equipe Diversité Ichtyologique et Aquaculture
Emailmedia.fitri@kkp.go.id
Tél. +33 (0)4 67 14 42 39
Localisation Bât. 22 - 2ième étage
Mots clés poissons arc-en-ciel Papouasie Occidentale variabilité génétique phylogénie conservation

Je suis étudiante en thèse dans le cadre d’une co-tutelle entre l’Agricultural University of Bogor (IPB), Indonésie, et l’Université Montpellier II (UM2), France (co-directeur français: Dr. Jean-Christophe Avarre. Mon project de recherche s’intitule: « Variabilité génétique des poissons arc-en-ciel de Papouasie occidentale: phylogénie, génétique des populations et conservation ».

Les Melanotaeniidae, appelés aussi poissons arc-en-ciel, sont endémiques de la Papouasie et du nord de l’Australie. En raison de l’extrême diversité de coloration de leur robe, ils sont très recherchés par les aquariophiles. Ainsi, beaucoup d’espèces de ce groupe sont en voie de disparition. Les espèces qui composent cette famille sont le plus souvent endémiques d’un affluent ou d’un lac. Elles sont présentes dans tous les environnements dulçaquicoles entre le niveau de la mer et 1600 m d’altitude, aussi bien dans des lacs que dans des rivières calmes ou tumultueuses. Ces poissons sont d’origine marine et ont évolué par vicariance depuis le Gondwana (150 millions d’années). La taxonomie de cette famille est actuellement en cours de révision, en particulier grâce à de nouveaux critères morphologiques.

L’objectif de ma thèse est triple:
1) estimer la diversité et la structuration génétique des espèces et des populations du milieu naturel, afin de comprendre et d’interpréter les patrons de diversification des poissons arc-en-ciel au cours de l’évolution;
2) estimer la variabilité génétique des souches d’élevage des espèces domestiquées afin d’évaluer le degré de consanguinité et les possibles hybridations, dans une optique de viabilité de l’activité d’élevage; et
3) estimer et interpréter les fluctuations spatio-temporelles de la variabilité génétique des espèces domestiquées et/ou menacées à des fins de conservation.  

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Text of presentation:

I am a doctoral student under a joint agreement between the Agricultural University of Bogor (IPB), Indonesia, and the University of Montpellier II (UM2), France (French co-supervisor: Dr. Jean-Christophe Avarre). My research project is entitled: « Genetic variability of rainbow fishes from West Papua: phylogeny, population genetics and conservation ».

The Melanotaeniidae, also called « rainbowfish » are endemic to Papua New Guinea and northern Australia. Because of their wide color variety, they are highly sought by aquarists. Thus, many species of this group are endangered. Species that make up this family are most of the time endemic to a tributary or a lake. They inhabit extremely diverse environments and are present in all freshwater environments between sea level and 1600 m, in lakes as well as in calm or tumultuous rivers. These fish are of ancient marine origin and have evolved from the Gondwana (150 million years) through vicariance. The taxonomy of this family is currently under review, particularly thanks to the use of new morphological criteria and of mitochondrial and nuclear molecular markers. This group of fish has become a priority for the Indonesian government in terms of conservation of ornamental fish.

The objectives of my thesis are as follow: 1) estimate the genetic diversity and structure of species and populations from the natural environment, in order to understand and interpret the patterns of diversification of rainbowfish during evolution; 2) evaluate the genetic variability of breeding strains of domesticated species to assess the degree of inbreeding and the possible hybridizations, in view of promoting the sustainability of the farming activity; and 3) estimate the genetic variability within time of domesticated and / or threatened species in the purpose of conservation.

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Cinq publications les plus significatives :

  1. Media Fitri Isma Nugraha, I Wayan Subamia, Sudarto, and Wahyu Purbowasito.  2011 Sex Determination in Indonesian Pufferfish Tetraodon palembangensis Bleeker, 1852: Implication for Aquaculture and Conservation. Indonesian aquaculture journal, Vol 6 No 1, 2011. Page 37-45
  2. Media Fitri Isma Nugraha, Gede Sumiarsa. 2009. The Invading non-native species on the Copepodes culture  in the closed system., Media Aquaculture, Vol. 1. Page 45-49
  3. Media Fitri Isma Nugraha and Gede S.Sumiarsa.  2009.  Abundance of copepod species (order : Calanoida) at Pegametan Bay North Bali. Jurnal  Riset Aqaculture Indonesia vol 4 No.1. Page 55-63
  4. Media Fitri Isma Nugraha, Gede S.Sumiarsa, Adi Hanafi.  2008. The biodiversity and vertical migration of copepod in Sumberkima bay, North Bali. Indonesia Aquaculture Journal  Vol 3.  Page 375-383
  5. I Wayan Subamia, Media Fitri Isma Nugraha,Slamet Sugito.  2008. Stage of development of the embryo of palmas fish (Polypterus senegalus senegalus).  Indonesian Aquaculture Journal. Voleme 3 number 2. Page119-124