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Etienne Loire

Post-Doctorant(e) Equipe Sexe et Spéciation
Emailetienne.loire@univ-montp2.fr
Tél. +33 (0)4 67 14 92 70
Localisation bâtiment 22, 1er étage
Mots clés Bioinformatique Evolution moléculaire Génétique des populations Spéciation Zone hybride

Je m’intéresse à l’évolution biologique à l’échelle moléculaire. J’utilise à cette fin des outils bioinformatiques pour chercher dans les génomes des traces de l’histoire évolutive des organismes vivants.
Mon projet de recherche, mené avec Carole Smadja et Pierre Boursot, est basé sur l’étude du maintien de la divergence entre deux sous-espèce de la souris domestique européenne (Mus musculus musculus et Mus musculus domesticus) et plus particulièrement à la base génétique de la sélection sexuelle au sein de la zone hybride qui voit la rencontre de ces deux populations.
Mon activité est financée grâce à ANR blanche ’ASSORTMATE’ (2010-2014, coordination : G. Ganem, France).

Reference-Free Population Genomics from Next-Generation Transcriptome Data and the Vertebrate–Invertebrate Gap.
Gayral P, Melo-Ferreira J, Glémin S, Bierne N, Carneiro M, Nabholz B, Lourenco JM, […] , Loire E , Bernard A, Galtier N.
PLoS genetics. 2013 April, e10034579

Evolution of coding microsatellites in primate genomes.
Loire E, Higuet D, Netter P, Achaz G.
Genome Biol Evol. 2013 Jan;5(2):283-95

The coupling hypothesis: why genome scans may fail to map local adaptation genes.
Bierne N, Welch J, Loire E, Bonhomme F, David P.
Mol Ecol. 2011 May;20(10):2044-72

Hypermutability of genes in Homo sapiens due to the hosting of long mono-SSR.
Loire E, Praz F, Higuet D, Netter P, Achaz G.
Mol Biol Evol. 2009 Jan;26(1):111-21

Nonsense-mediated mRNA decay impacts MSI-driven carcinogenesis and anti-tumor immunity in colorectal cancers.
El-Bchiri J, Guilloux A, Dartigues P, Loire E, Mercier D, Buhard O, Sobhani I, de la Grange P, Auboeuf D, Praz F, Fléjou JF, Duval A.
PLoS One. 2008 Jul 9;3(7):e2583