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Carole Smadja

Chargé(e) de recherche CNRS Equipe Sexe et Spéciation
Emailcarole.smadja@univ-montp2.fr
Tél. +33 (0)4 67 14 92 70
Localisation bâtiment 22, 1er étage
Mots clés Spéciation Adaptation Sélection sexuelle/naturelle Génomique des populations Évolution moléculaire NGS Comportement Choix du partenaire Spécialisation écologique Olfaction

Mes recherches s’intéressent à la spéciation, un processus évolutif fondamental responsable de l’élaboration de nouvelles formes biologiques et du maintien de la biodiversité. Mon objectif est de mieux comprendre l’évolution de barrières au flux génique et le rôle de la sélection dans la formation de nouvelles espèces. Je développe essentiellement des approches phénotypiques et de génomique évolutive pour retracer les scénarios de divergence entre populations, et je travaille sur différents modèles biologiques (souris, pucerons, palmiers) pour étudier différent scénarios de spéciation en présence de flux de gènes (renforcement, spéciation écologique…). Ces dernières années, j’étudie plus particulièrement l’évolution de systèmes de reconnaissance olfactifs qui contribuent à l’établissement de barrières pré-zygotiques.

Publications récentes:

Loire E*, Tusso S*, Camidade P, Severac D, Boursot P, Ganem G, Smadja CM (*joint first authors). Do changes in gene expression contribute to sexual isolation and reinforcement in the house mouse? 2017. Molecular Ecology DOI: 10.1111/mec.14212

Hurst JL, Beynon RJ, Armstrong SD, Davidson AJ, Roberts SA, Gómez-Baena G, Smadja CM, Ganem G. 2017. Molecular heterogeneity in major urinary proteins of Mus musculus subspecies: potential candidates involved in speciation. Scientific Reports 7, 44992

Eyres I, Duvaux D, Gharbi K, Tucker R, Simon JC, Ferrari J*, Smadja CM*, Butlin RK* (*joint last authors). 2017. Targeted re-­sequencing confirms the importance of chemosensory genes in aphid host race differentiation. Molecular Ecology 26(1):43-58

Eyres I, Jaquiéry J, Sugio A, Duvaux L, Gharbi K, Zhou JJ , Legeai F, Nelson M, Simon JC, Smadja CM*, Butlin RK*, Ferrari J* (* joint last authors). 2016. Differential gene expression according to race and host plant in the pea aphid. Molecular Ecology 25(17):4197-4215

Hipperson H, Dunning LT, Baker WJ, Butlin RK, Hutton I, Papadopulos AST, Smadja CM, Wilson TC, Devaux C, Savolainen V. 2016. Ecological speciation in sympatric palms: 2. Pre- and post-zygotic isolation. Journal of Evolutionary Biology 29(11):2143-2156

Dunning LT, Hipperson H , Baker WJ, Butlin RK, Devaux C, Hutton I, Igea J, Papadopulos AST, Quan X, Smadja CM, Turnbull CGN, Savolainen V. 2016. Ecological speciation in sympatric palms: 1. Gene expression, selection and pleiotropy. Journal of Evolutionary Biology 29(8):1472-1487

Smadja CM*, Loire E*, Caminade P, Thoma M, Latour Y, Roux C, Thoss M, Penn DJ, Ganem G and Boursot P (* joint first authors). 2015. Seeking signatures of reinforcement at the genetic level: a hitchhiking mapping and candidate gene approach in the house mouse. Molecular Ecology 24 (16), 4222-4237

Duvaux L, Geissmann Q, Gharbi K, Zhou JJ, Ferrari J*, Smadja CM* and Butlin RK* (*joint last authors). 2015. Dynamics of copy number variation in host races of the pea aphid. Molecular Biology and Evolution 32 (1), 63-80

Peccoud J, de la Huerta M, Bonhomme J, Laurence C, Outreman Y, Smadja CM and Simon JC. 2014. Widespread ecological hybrid unfitness in the pea aphid species complex. Evolution 68 (10), 2983-2995

Latour Y, Perriat-Sanguinet M, Caminade P, Boursot P, Smadja CM and Ganem G. 2014. Sexual selection against natural hybrids: a barrier to gene flow in a house mouse hybrid zone? Proceedings of the Royal Society of London B. 281 (1776): 20132733

Review articles:

The FroSpects Gregynog Workshop. 2013. Hybridization and speciation. Target review. Journal of Evolutionary Biology 26(2):229-246

Smadja CM and RK Butlin. 2011. A framework for comparing processes of speciation in the presence of gene flow. Molecular Ecology 20:5123-5140

Stapley J, Reger J, Feulner PGD, Smadja C, Galindo J, Ekblom R, Benisson C, Ball AD, Beckerman A and Slate J. 2010. Adaptation genomics: the next generation. Trends in Ecology and Evolution 25(12):705-712

Smadja C and Butlin RK. 2009. Invited review: On the scent of speciation: the chemosensory system and its role in premating isolation. Special issue « Genetics of speciation ». Heredity 102(1): 77-97

Liste COMPLETE des Publications :

Google Scholar

Research Gate profile

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Projets de recherche principaux :

Evolution de l’isolement sexuel et renforcement chez la souris domestique

Financements obtenus:
– ANR blanche ’ASSORTMATE’ (2010-2016, coordination : G. Ganem, France)

– Marie Curie Reintegration Grant (FP7 European Commission) ’SPECIATION GENOMICS’ (2010-2013, coordination : C. Smadja, France)

Spéciation écologique et spécialisation d’hôte chez le puceron du pois

Financements obtenus:
– NERC British research council grant ’Aphid host association’ (2012-2016, coordination : R. Butlin, UK)

– ANR blanche ‘SPECIAPHID‘ (2012-2016, coordination : JC Simon, France)

– NERC British research council grant ’Chemosensory genes and the evolution of aphid host races’ (2010-2012, coordination : R. Butlin, UK)

– Marie Curie EIF fellowship (FP6 European Commission) ‘Genetics of speciation in the pea aphid’ (2007-2009, coordination: C. Smadja)

Autres projets financés:

- Génomique, transcriptomique et épigénomique de l’adaptation à la plante hôte chez la pyrale du Maïs (Ostrinia ssp). ANR AdaptOme (2014-2018) En collaboration avec Réjane Streiff (INRA CBGP), Denis Bourguet (INRA CBGP), Renaud Vitalis (INRA CBGP), Emmanuelle d’Alençon (INRA DGIMI), Nicolas Nègre (INRA DGIMI) et Sergine Ponsard (U. Paul Sabatier Toulouse). 

- Hybridization, adaptation and historical demongraphy: a population genomics approach. ANR HybridAdapt (2013-2015). En collaboration avec Pierre Boursot (CNRS ISEM), Françoise Bonhomme (CNRS ISEM), Khalid Belkhir (CNRS ISEM).

- Sympatric speciation in the oceanic Lord Howe island

En collaboration avec Vincent Savolainen (Imperial College London UK), Helen Hipperson (Imperial College London UK), Alexander Papadopulos (Imperial College London UK), Roger Butlin (U. Sheffield UK), Bill Baker (Kew Gardens UK), Céline Devaux (Univ Montpellier, France). Financement ERC 2009-2014.