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Frédérique Cerqueira

ITA Equipe Evolution des Poissons Plateforme Plateforme de Génomique Environnementale (PGE/Labex)
Emailfrederique.cerqueira@umontpellier.fr
Tél. +33 (0)4 67 14 46 89
Localisation Bâtiment 24, 1er étage
Mots clés séquenceurs capillaires microsatellites séquençage AFLP GeneMapper

Gestion d’une plateforme de séquençage génotypage pour les laboratoires du labex CeMEB « Centre Méditerranéen de l’Environnement et de la Biodiversité » https://genseq.umontpellier.fr/WordPress/.
Maintenance et utilisation des différents instruments mis à la disposition des utilisateurs dont un séquenceur d’électrophorèses capillaires pour des analyses de tailles de fragments (microsatellites) ou des séquences type Sanger et un séquenceur NGS. Le séquenceur Nouvelle Génération de Séquençage est un MiSeq, il permet le séquençage massif d’amplicons, la réalisation de barcoding environnemental, l’analyse de transcriptome ou de métagénomique. Conseil, formation et application pour le séquençage, le génotypage, le dosage des acides nucléiques, l’extraction d’ADN, la sonication et la préparation de certaines banques NGS.

1 Rayda Siala1, Ines Ben Chobba1, Tatiana Vallaeys2, Mohamed Ali Triki3, Mouna Jrad3, Manel Cheffi3, Imen Ayedi4, Amine Elleuch1, Ahmad Nemsi5, Frederique Cerqueira6, Radhouane Gdoura7, Noureddine Drira1, Néji Gharsallah1.Analysis of the Cultivable Endophytic Bacterial Diversity in the Date Palm (Phoenix dactylifera L.) and Evaluation of Its Antagonistic Potential against Pathogenic Fusarium Species that Cause Date Palm Bayound Disease.Journal of Applied & Environmental Microbiology, 2016, Vol. 4, No. 5, 93-104

2 Carvajal-Vallejos FM1, Duponchelle F, Desmarais E, Cerqueira F, Querouil S, Nuñez J, García C, Renno JF.Genetic structure in the Amazonian catfish Brachyplatystoma rousseauxii: influence of life history strategies.Genetica. 2014 Aug;142(4):323-36.

3 Ben Chobba I1, Elleuch A, Ayadi I, Khannous L, Namsi A, Cerqueira F, Drira N, Gharsallah N, Vallaeys T.Fungal diversity in adult date palm (Phoenix dactylifera L.) revealed by culture-dependent and culture-independent approaches.J Zhejiang Univ Sci B. 2013 Dec;14(12):1084-99.

4 Barnabe C1, Buitrago R, Bremond P, Aliaga C, Salas R, Vidaurre P, Herrera C, Cerqueira F, Bosseno MF, Waleckx E, Breniere SF.Putative panmixia in restricted populations of Trypanosoma cruzi isolated from wild Triatoma infestans in Bolivia.PLoS One. 2013 Nov 29;8(11):e82269.

5 Fornůsková A1, Vinkler M, Pagès M, Galan M, Jousselin E, Cerqueira F, Morand S, Charbonnel N, Bryja J, Cosson JF.Contrasted evolutionary histories of two Toll-like receptors (Tlr4 and Tlr7) in wild rodents (MURINAE).BMC Evol Biol. 2013 Sep 12;13:194.

6 Bruno Guinand , Eric D.H. Durieux , Célie Dupuy , Frédérique Cerqueira , Marie-Laure Bégout.Phenotypic and genetic differentiation in young-of-the-year common sole (Solea solea) at differentially contaminated nursery grounds.Marine Environmental Research. Mar Environ Res. 2011 Apr;71(3):195-206.

7 Delaval K, Govin J, Cerqueira F, Rousseaux S, Khochbin S, Feil R. Differential histone modifications mark mouse imprinting control regions during spermatogenesis. EMBO J. 2007 Feb 7;26(3):720-9.

8 Umlauf D, Goto Y, Cao R, Cerqueira F, Wagschal A, Zhang Y, Feil R.Imprinting along the Kcnq1 domain on mouse chromosome 7 involves repressive histone methylation and recruitment of Polycomb group complexes. Nat Genet. 2004 Dec; 36(12):1296-300.